Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 1700009N14Rik-201ENSMUST00000029955 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Znf48Q3US17 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Zfp940-201ENSMUST00000085792 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Znf48Q3US17 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Znf48Q3US17 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Znf48Q3US17 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Znf48Q3US17 AC121942.3-201ENSMUST00000225768 1436 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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Znf48Q3US17 Gm40841-202ENSMUST00000222823 3989 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Znf48Q3US17 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Znf48Q3US17 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Znf48Q3US17 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 n-R5s28-201ENSMUST00000082814 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Znf48Q3US17 Gm5442-201ENSMUST00000202121 2034 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms