Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Trafd1Q3UDK1 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms