Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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