Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Rnf149Q3U2C5 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Rnf149Q3U2C5 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Rnf149Q3U2C5 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Rnf149Q3U2C5 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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