Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms