Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RhoP15409 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RhoP15409 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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