Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm21411J3KMS0 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm21411J3KMS0 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms