Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rrn3B2RS91 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Rrn3B2RS91 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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