Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Ak7-201ENSMUST00000040876 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Zfp286-201ENSMUST00000054654 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm28177-201ENSMUST00000185516 3532 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Mkl1-201ENSMUST00000109579 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Parva-203ENSMUST00000106643 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Parpbp-201ENSMUST00000048518 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm13081-201ENSMUST00000121527 5599 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Aldh2-201ENSMUST00000031411 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm38383-201ENSMUST00000194131 2660 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm12834-201ENSMUST00000121855 2829 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Tenm4-202ENSMUST00000107165 10930 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Nol12-203ENSMUST00000138880 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Adtrp-201ENSMUST00000072012 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm18637-201ENSMUST00000217665 1900 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Fmnl1-203ENSMUST00000107027 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm8464-201ENSMUST00000140208 2200 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Gm4750-202ENSMUST00000152262 2200 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 C78197-201ENSMUST00000152781 3417 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SrfQ9JM73 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms