Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm8529-201ENSMUST00000183298 745 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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Rabgef1Q9JM13 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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