Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm12930-201ENSMUST00000146679 676 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 1700021F13Rik-202ENSMUST00000202665 469 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm25129-201ENSMUST00000082651 133 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Nop56Q9D6Z1 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms