Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snapc3Q9D2C9 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snapc3Q9D2C9 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Snapc3Q9D2C9 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Snapc3Q9D2C9 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Snapc3Q9D2C9 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms