Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms