Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Nhlrc3Q8CCH2 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
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