Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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