Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms