Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms