Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NipblQ6KCD5 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NipblQ6KCD5 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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