Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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