Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ctdnep1Q3TP92 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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