Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SbdsP70122 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SbdsP70122 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms