Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rrp1P56183 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms