Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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VdrP48281 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
VdrP48281 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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VdrP48281 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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VdrP48281 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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