Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprkP35822 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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