Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms