Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
RxraP28700 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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