Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
P20040 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
P20040 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
P20040 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
P20040 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
P20040 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
P20040 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
P20040 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
P20040 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
P20040 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
P20040 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
P20040 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
P20040 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
P20040 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P20040 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms