Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PdgfaP20033 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm19810-201ENSMUST00000218521 251 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PdgfaP20033 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms