Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Vpreb2P13373 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Vpreb2P13373 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms