Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp35M0QWN7 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp35M0QWN7 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms