Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Gm20795J3QP49 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms