Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cldn34c3J3QJW5 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms