Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-M1F7CXU4 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms