Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Clrn2B2RVW2 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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