Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Usf3B2RUQ2 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms