Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Spocd1B1ASB6 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms