Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Grik3B1AS29 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms