Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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Rabgef1Q9JM13 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr212-202ENSMUST00000218028 2291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rabgef1Q9JM13 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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