Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp29Q9ES63 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms