Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rprd1bQ9CSU0 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms