Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
PtprtQ99M80 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PtprtQ99M80 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms