Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCS6

Pabpn1, Polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1Q8CCS6 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pabpn1Q8CCS6 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pabpn1Q8CCS6 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pabpn1Q8CCS6 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pabpn1Q8CCS6 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pabpn1Q8CCS6 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pabpn1Q8CCS6 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pabpn1Q8CCS6 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pabpn1Q8CCS6 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Fgf13-202ENSMUST00000119306 2091 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm13110-201ENSMUST00000138077 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pabpn1Q8CCS6 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms