Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Actn1Q7TPR4 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Actn1Q7TPR4 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms