Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Usp49Q6P9L4 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Usp49Q6P9L4 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Usp49Q6P9L4 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp49Q6P9L4 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp49Q6P9L4 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp49Q6P9L4 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp49Q6P9L4 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp49Q6P9L4 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp49Q6P9L4 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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