Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxa13Q62424 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxa13Q62424 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxa13Q62424 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Hoxa13Q62424 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxa13Q62424 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms