Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sft2d1Q5SSN7 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sft2d1Q5SSN7 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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