Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Usp39Q3TIX9 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp39Q3TIX9 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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