Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Trim71Q1PSW8 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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