Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SbdsP70122 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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