Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
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PtprmP28828 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PtprmP28828 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
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